企业留存收益的来源包括：

留存收益包括净利润和盈余公积，其中净利润是企业经营成果的积累，盈余公积是企业从净利润中提取的留存部分，因此C选项正确。A选项混淆了资本公积的来源，D选项错误将实收资本归为留存收益。