公司治理的主要问题包括股东与管理层之间的利益冲突、____与中小股东之间的利益冲突以及公司与其他利益相关者之间的利益冲突。

根据教材原文，三类利益冲突中第二类为控股股东与中小股东之间的冲突，填空处应填'控股股东'。干扰项可能涉及'管理层'或'债权人'等无关主体。